神秘的甄葦大博士突然回來了，孔東東借用甄葦大博士發明的“大大粉”，把西紅柿和寵物狗都變成了巨型物種，并且也把自己變成了巨人。變成巨人的孔東東被關在動物園里，他想借助酸梅糖的神秘力量，讓自己擺脫困境，沒想到酸梅糖卻在緊要關頭失靈了。幸好，甄葦大博士還有新的發明——能讓人想去哪里就去哪里的斗篷和能讓時光倒流的手表。有了這兩樣“法寶”，孔東東和孔西西踏上了一段不可思議的旅程——他們來到深夜的圖書館，進入了一個又一個的童話世界里……